首轮建设虽然总体上实现了建设目标，但实际建设时间还不长，有些学科因各方面原因，建设成效并未完全达到预期，相比其他同类建设学科，整体发展水平、可持续发展能力和成长提升程度相对靠后，为激励督促，也是为了警示其他建设学科，需要给予这些学科公开警示的处理。
经“双一流”建设专家委员会严格评议，个别被公开警示的建设学科按要求结合学校定位、首轮建设成效和学科特色优势，作出调整，原学科撤销。警示学科和调整后的学科，2023年接受再评价，届时未通过的，将调出建设范围。
给予公开警示（含撤销）的首轮建设学科名单
（按学校代码排序）
北京中医药大学：中药学
内蒙古大学：生物学
辽宁大学：应用经济学
东北师范大学：数学（予以撤销，根据学科建设情况调整为“教育学”）
延边大学：外国语言文学
上海财经大学：统计学（予以撤销，根据学科建设情况调整为“应用经济学”）
宁波大学：力学
安徽大学：材料科学与工程
华中师范大学：中国语言文学
中南财经政法大学：法学
广西大学：土木工程
西藏大学：生态学
宁夏大学：化学工程与技术
新疆大学：化学、计算机科学与技术
海军军医大学：基础医学
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